Pithart és Klaus a továbbjutók
A 2. választási fordulóba a kereszténydemokrata Petr Pithart és a polgári demokrata Václav Klaus jutott tovább. Klaus a képviselőházban, Pithart pedig a szenátusban kapta a legtöbb szavazatot a négy jelölt közül. Az első forduló hivatalos eredményét az ebédszünetet követően, délután hozzák nyilvánosságra.
Az első fordulóban a képviselőház és a szenátus külön-külön szavazott. A győzelemhez egy jelöltnek a 200 tagú képviselőház, valamint a 81 tagú szenátus összes tagjai szavazatainak a többségét (101, illetve 41 szavazat) kellett volna megszereznie, ami most senkinek sem sikerült. Klaus a képviselőházban 92, Pithart a szenátusban 35 szavazattal lett az első.
Sikertelenség esetén ismétlés
A második fordulóban a parlament két háza ismét külön szavaz. Itt a győzelemhez a jelöltnek a leadott szavazatok több mint a felét kell megszereznie mindkét házban. A harmadik fordulóban aztán a képviselők és a szenátorok már közösen szavaznak, s a győzelemhez a leadott összes szavazat több mint a felét kell megszerezni az egyik jelöltnek.
Amennyiben egyetlen jelölt sem kapja meg a megfelelő számú szavazatot a három fordulóban, akkor a választást meg kell ismételni, mégpedig a jelölési procedúrával együtt.