Az SZDSZ szerint egy állami szerv nem dönthet teológiai kérdésekben, és a módosítás alkotmány- és egyházellenes. Fodor Gábor hivatkozott az Európa Tanács 1990-es ajánlására is, amely szerint a hatóságoknak tartózkodniuk kell az értékítéleten alapuló döntésektől.
Ellenőrizhetetlen kisegyházak
A kormányoldal képviselői szerint a jelenlegi törvény semmit sem szabályoz, egyházat bárki létrehozhat, csupán bejelentési kötelezettsége van. Semjén Zsolt és Sanda Balázs, a módosítás beterjesztői szerint, az államnak meg kell határoznia az egyházat, mint ,,jogi személyt", és ennek alapján lehetne eldönteni, hogy ki kapja meg az egyházi státuszt.
Hargitai János (FIDESZ) az Európa Parlament állásfoglalására hívta fel Fodor Gábor figyelmét, amely szerint az egyházi státusz adományozása kellő megfontoltságot igényel, és ha kell, akkor azt meg is lehet vonni. A politikus kifogásolta, hogy az ügyészség a minimális információkhoz sem juthat hozzá az egyházakról, és a szabályozás hiánya miatt nem is tud fellépni az esetleges visszaélésekkel szemben.
A MIÉP szerint jó az irány
A vita alatt Donáth László (MSZP) evangélikus lelkész és Hegedűs Lóránt(MIÉP) református lelkész gyakran bibliai idézetekkel támasztották alá érveiket. A MIÉP szerint még ez a javaslat sem elég szigorú, de ,,jó irányba mutat", ezért támogatják azt.