Az APEH Bűnügyi Igazgatóságának vezetősége szerint a jelenlegi hatékony működés továbbviteléhez elengedhetetlen, hogy önálló szervezetben maradjon meg az adónyomozás.
Az elkészített alternatív javaslat szerint az igazgatóság felügyeletét az adóhivatal elnöke helyett a Pénzügyminisztérium látná el. Így megmaradhatna az adónyomozók önállósága, akik az európai uniós csatlakozást követően egyesülnének az átszervezett vámosokkal. A javaslat alapján az uniós csatlakozást követően már létre lehetne hozni egy, a pénzügyi bűncselekményekkel összevontan foglalkozó nyomozó szervezetet is.