Farkas Árpád február elején visszautasította a Magyar Köztársaság Középkeresztjét arra hivatkozva, hogy a december 5-i népszavazás után nem tekinthet el a magyar kormány szerepétől e kitüntetés odaítélésében. Levélben kért elnézést a magyar köztársasági elnöktől, hangsúlyozván: "az Ön sepsiszentgyörgyi, nemzeti sorskérdéseink iránt érdeklődő látogatása alkalmából futólag nyújtott kézszorítása többet jelent számomra minden, e jelenlegi kormány által javasolt és érintett érdemrendnél". Mádl Ferenc ezt követően döntött arról, hogy az általa alapított kitüntetést adományozza Farkas Árpádnak, aki ezt elfogadta.
Mádl Ferenc 2001. november 29-én alapította a Magyar Köztársaság Elnökének Érdemérme kitüntetést, a magyar állami elismerések között az egyetlent, amelyet nem miniszterelnöki vagy miniszteri előterjesztésre adományozhat az államelnök. Az elmúlt három évben olyan személyiségeket tüntetett ki, akik életútjukkal, szakmai tevékenységükkel kiemelkedő érdemeket szereztek a tudományos vagy jótékonysági munkában, a művészi alkotói és előadói, illetve a köz szolgálatában végzett tevékenységükkel.