A CSU szombaton véget ért rendkívüli kongresszusán a küldöttek hatalmas többséggel választották meg az eddig a bajor belügyminiszteri tisztséget betöltő, 63 éves Becksteint új kormányfővé, s ugyancsak nagy többséggel a 61 esztendős gazdasági miniszter Hubert a párt új elnökévé. Egyben elbúcsúzott pártjától a 66 éves Edmund Stoiber, aki tizennégy éven keresztül állt a tartományi kormány, s nyolc éve a CSU élén.
A választási kampány kilenc hónapig tartott, Edmund Stoiber ugyanis még idén januárban jelentette be, hogy az ősz folyamán távozik mindkét tisztségéből. A bejelentést megelőző időszakban ugyanis nem utolsósorban több hibás döntése nyomán erősen csökkent a párt népszerűsége, s mind többen követelték, hogy a CSU immár nélküle vágjon neki a jövő évben esedékes tartományi parlamenti és az egy évvel későbbi szövetségi választásoknak.