Az egyesület idén alakult át részvénytársasággá. Beckenbauer a felügyelőbizottság elnökeként Karl-Heinz Rummenigge alelnökkel és Uli Hoeness menedzserrel irányítja a klubot. Ezenkívül ő a vezetője a 2006-os vb szervezőbizottságának is.
- A koreai-japán közös rendezésű vb után elkezdődik az igazi munka, a következő négy évben napi 10-12 órát kell dolgoznom, és egyszerűen nem marad elég időm a Bayern Münchenre - mondta Beckenbauer. - A végleges döntést azonban csak nyáron hozom meg.
Német lapok szerint a "Császár" azért foglalkozik a távozás gondolatával, mert az új klubmodellben Rummeniggének, valamint Hoenessnek több beleszólási joga van az egyesületet érintő kérdésekbe, és ez már kisebb konfliktusokhoz vezetett a triumvirátus tagjai között.