Maldini 1985 januárjában mutatkozott be a milánóiak felnőtt együttesében, s pályafutása során soha nem játszott más egyesület színeiben. A vörös-feketékkel hét bajnoki cím és négy BEK, illetve Bajnokok Ligája elsőség részese volt.
A legendás hátvéd összesen 126-szor húzhatta magára az olasz válogatott mezét, ezzel csúcstartó hazájában. Maldini a 2002-es vb után mondta le a további szereplést a nemzeti együttesben, s az aktuális szövetségi kapitány mindig megpróbálta rábeszélni - eddig sikertelenül - a visszatérésre.